До настоящего времени территорией г. Йошкар-Олы, наиболее подверженной затоплению в период паводков, остается микрорайон Ширяйково. Основными причинами, вызывающими затопление, является обмеление реки Малая Кокшага, а также захламленность русла ниже водосливной плотины завалами из деревьев, различным мусором.
С целью решения вопроса в 2017-2019 гг. специалистами Минприроды Республики Марий Эл совместно с ГБУ Республики Марий Эл «Марийская аварийно-спасательная служба», ГБУ Республики Марий Эл «Маргеомониторинг», ФГБУ Поволжский государственный технологический университет проводилось визуальное и водолазное обследование русла реки Малой Кокшаги на участке от городской водосливной плотины до моста автомобильной дороги федерального значения «Вятка».
Улучшение состояния окружающей среды — основная цель нацпроекта «Экологическое благополучие», в который входит проект «Вода России».
В результате обследования выявлено, что русло реки извилистое, местами отделяется в старицы, захламлено упавшими деревьями, массовыми завалами, которые препятствуют свободному току воды и приводят к затоплению территорий. Общее количество полузатонувших и затонувших предметов более 1400 штук с общим объемом 2114 м3.
С целью защиты 40 жилых зданий, 3-этажной школы им. Лени Голикова, 2-этажного детского сада «Рябинушка» и иных социальных объектов 2022 году разработан проект по руслорегулированию реки Малой Кокшаги.
Экономически эффективным вариантом защиты от паводковых вод выбран вариант, предусматривающий дноуглубление реки на протяжении 7,6 км, разбор завалов, перегораживающих русло реки, подъем и удаление затопленных деревьев, формирование двух участков спрямления русла, уборка аварийных деревьев, расположенных
на откосе берега реки.
Срок реализации мероприятия: 2025 — 2028 годы.
В настоящее время произведена уборка аварийных деревьев ведутся работы по дноуглублению.
Только на пройденном дноуглублением участке русла длиной 50 метров уже со дна реки подняты автомобильные шины, топляки, велосипедные рамы, диван, газовый баллон и многие другие предметы.